Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms