Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhbdd3Q8BP97 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd3Q8BP97 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms