Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo38Q8BMI0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo38Q8BMI0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms