Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms