Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc2Q8BKV1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms