Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms