Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4dQ8BGV9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms