Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Vipas39Q8BGQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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