Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sv2bQ8BG39 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms