Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT9

Svop, Synaptic vesicle 2-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvopQ8BFT9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SvopQ8BFT9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvopQ8BFT9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms