Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd4Q8BFT6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd4Q8BFT6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd4Q8BFT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms