Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.5Q85ZW7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms