Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms