Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc172Q810N9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms