Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChfrQ810L3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChfrQ810L3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms