Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms