Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc1Q80VQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms