Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll4Q80V24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms