Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clasp1Q80TV8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clasp1Q80TV8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clasp1Q80TV8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms