Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf8Q80TJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf8Q80TJ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf8Q80TJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf8Q80TJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms