Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clec18aQ7TSQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms