Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IfnkQ7TSL0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms