Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Shq1Q7TMX5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms