Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms