Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms