Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms