Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms