Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms