Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms