Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms