Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinlQ6ZQ12 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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