Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf653Q6YND2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms