Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms