Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak1Q6PD31 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms