Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd3Q6P9Z1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms