Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp49Q6P9L4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp49Q6P9L4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms