Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms