Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx19Q6P4T1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx19Q6P4T1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms