Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frg2f1Q6P3A2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms