Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp7Q6A4J8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms