Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms