Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms