Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BegainQ68EF6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BegainQ68EF6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms