Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms