Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno1Q689Z5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms