Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q66JV7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q66JV7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q66JV7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q66JV7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms