Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VclQ64727 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VclQ64727 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VclQ64727 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VclQ64727 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VclQ64727 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VclQ64727 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms