Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf2Q64705 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms