Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja3Q64448 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja3Q64448 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms