Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pan3Q640Q5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms